สำนักควบคุมพืชและวัสดุการเกษตร กรมวิชาการแนะ เกษตรกรเลือกต้นพันธุ์ทุเรียนต้นพันธุ์ทุเรียนมาปลูกซ่อมหรือปลูกสร้างสวนใหม่ การเลือกต้นพันธุ์มาปลูกนับว่ามีความสำคัญอย่างยิ่ง ถ้าเลือกต้นพันธุ์ได้ดีก็มีโอกาสสำเร็จสูง แต่ถ้าเลือกต้นพันธุ์ที่ไม่ดีมาปลูกจะทำให้เสียเวลาและเสียโอกาสเข้าทำนอง”เลือกต้นพันธุ์ผิดคิดจนตัวตาย”

หลักการเลือกต้นพันธุ์ทุเรียน 1.ตรงตามพันธุ์ที่ต้องการ  2.สมบูรณ์แข็งแรง รากไม่ขดงอ 3.ปราศจากโรคและแมลง 4.ต้นตอมาจากพันธุ์ที่แข็งแรงต้านทานโรครากเน่าโคนเน่า

หลายท่านมักเลือกต้นพันธุ์ที่มีขนาดใหญ่มาปลูกเพราะคิดว่าโตเร็วและจะให้ผลผลิตเร็ว ซึ่งก็ไม่ผิดแต่สิ่งที่ต้องคำนึงก็คือ ต้นพันธุ์ที่อยู่ในถุงเพาะชำเป็นเวลานานจะทำให้รากขดงอ ถ้ามีการเปลี่ยนถุงหลายครั้งก็จะเกิดการขดงอของรากหลายชั้น เมื่อเอาไปปลูกก็จะแคระแกร็นและระบบรากที่ขดงอทับซ้อนกันจะทำให้เกิดเป็นโรครากเน่าโคนเน่าจากเชื้อไฟทอปธอราได้ง่าย แต่อย่างไรก็ตามเราสามารถแก้ปัญหารากขดงอของต้นพันธุ์ทุเรียนก่อนปลูกได้ 2 วิธีคือ

การปลูกแบบตัดราก ใช้มีดกรีดถุงเพาะชำออกแล้วใช้กรรไกรตัดรากที่ขดงอก้นถุงและที่พันอยู่รอบๆออก จากนั้นตัดแต่งกิ่งและใบออกให้มีความสมดุลกับราก (Root-shoot ratio)วางลงในหลุมปลูกที่เตรียมไว้แล้ว พรางแสงและรดน้ำอย่างสม่ำเสมอ

การปลูกแบบจัดราก ใช้มีดกรีดถุงเพาะชำออกแล้วใช้กรรไกรตัดรากที่ขดงอก้นถุงออกเช่นเดียวกันส่วนรากที่ขดพันอยู่โดยรอบเราจะไม่ตัดออกแต่จะใช้วิธีค่อยดึงออกมาทีละเส้นจัดวางตามทิศทางที่เหมาะสม ค่อยๆกลบดินเป็นชั้นไป ทำแบบปราณีต พรางแสงและรดน้ำสม่ำเสมอ    อย่างไรก็ตามควรเลือกต้นพันธุ์ที่มีระบบรากไม่ขดงอจะดีที่สุดต้นทุเรียนจะโตเร็วแข็งแรงและมีความสม่ำเสมอกันทั้งสวน